Atelier d’analyse des données d’ARN-seq

Atelier d’analyse des données d’ARN-seq

Atelier d’analyse des données d’ARN-seq

Formation pratique en analyse des données d’ARN-seq

 
Présentez votre demande ici
 
Date limite pour présenter une demande : 21 avril 2026
Date de l’événement : 1er au 3 juin 2026
Endroit : en ligne

Nous joindre :
Si vous avez besoin de plus amples informations sur cet atelier ou avez quelque question relative à l’inscription, n’hésitez pas à communiquer avec nous à l’adresse trainingSCN@stemcellnetwork.ca

Les technologies de séquençage de l’ARN (RNA-seq) constituent un important outil pour la recherche biomédicale, notamment pour déterminer les mécanismes moléculaires qui régissent le devenir des cellules souches. Ce cours intensif permettra d’acquérir des connaissances théoriques et des compétences pratiques pour l’analyse des données RNA-seq en masse et en cellule unique.

Le Réseau de cellules souches (RCS) est heureux de proposer à nouveau ce populaire atelier sur l’analyse des données RNA-seq, qui comprend des séances couvrant les données RNA-seq à la fois en masse et en cellule unique. Le cours se donnera les 1er et 2 juin 2026 (et une séance de tutorat sur invitation aura lieu le 3 juin 2026).

Les personnes qui n’ont pas une connaissance approfondie de R seront encouragées à suivre le tutoriel offert en ligne sur ce sujet avant le début de leur série de séances – les détails sur le tutoriel offert en ligne sur R seront communiqués aux candidats retenus. Dans le cadre de cet atelier, une troisième journée de formation facultative sera offerte sur invitation seulement aux stagiaires disposant de leurs propres données RNA-seq. Cette séance de tutorat, consacrée à l’analyse de ces données, permettra aux participants d’interagir en ligne avec les instructeurs de l’atelier.

L’atelier est organisé par Ted Perkins et la Plateforme de bioinformatique d’Ottawa (Ottawa Bioinformatics Core Facility).

À qui s’adresse cette formation?

Cet atelier d’analyse des données RNA-seq s’adresse aux biologistes des cellules souches (et autres utilisateurs finaux) qui cherchent à comprendre les concepts et les processus bioinformatiques utilisés pour l’acquisition, l’analyse et l’interprétation des données RNA-seq en masse et en cellule unique.

Objectifs d’apprentissage

Par le biais de cours interactifs et d’exercices en laboratoire informatique, les participants se familiariseront avec l’acquisition et l’analyse des données RNA-seq et acquerront une expérience pratique en analyse de ces données. Le contenu du cours est axé sur les données RNA-seq, mais de nombreux éléments seront applicables aux données obtenues à partir d’autres plateformes telles que ChIP-seq et la spectrométrie de masse. 

Le cours fournira :

  • Une compréhension de base des technologies d’ARN-seq de masse et à cellule unique.
  • Une formation sur la manière de générer des listes de gènes différentiellement exprimés à partir de données brutes d’ARN-seq.
  • Une compréhension des différents tests statistiques utilisés pour analyser les ensembles de gènes.
  • Une expérience de l’utilisation des outils d’analyse de l’enrichissement de l’annotation fonctionnelle.
  • Une expérience en analyse des données d’ARN-seq en masse et à cellule unique.

Renseignements supplémentaires

L’atelier principal se tiendra sous forme d’une séance de deux journées, les 1er et 2 juin 2026. La troisième journée de l’atelier (3 juin 2026) sera offerte sur invitation seulement aux stagiaires qui possèdent leurs propres données RNA-seq et sera consacrée à l’analyse de ces données. Un soutien sera aussi fourni dans le cadre d’une interaction en ligne offerte avec les instructeurs de l’atelier.

Dates/heures (chaque séance se tiendra de 11 h à 17 h, HAE) :

Atelier principal : 1er et 2 juin 2026

Turorat sur invitation seulement : 3 juin 2026

Les participants qui n’ont pas une bonne connaissance de R seront encouragés à suivre le tutoriel en ligne sur R avant le début de l’atelier. Les détails sur ce tutoriel en ligne seront communiqués aux candidats retenus.

Comment présenter une demande

  • Remplissez le formulaire de demande ici au plus tard le 21 avril 2026 à 23 h 59 (heure d’expédition).
  • Fournissez votre CV en même temps que le formulaire de demande.
  • Une fois votre demande soumise, le ou la superviseur·e d’études que vous aurez indiqué·e plus haut recevra automatiquement un courriel contenant des instructions pour le téléversement de sa lettre d’appui confidentielle. Veuillez contacter cette personne pour vous assurer qu’elle a bien reçu ce courriel et que sa lettre sera soumise avant la date limite indiquée sur le site Web. Nous vous recommandons vivement de communiquer avec cette personne bien en amont de la date limite. Le Comité de formation et d’éducation du RCS examinera toutes les demandes remplies et les candidats seront informés des résultats du concours au cours d’ici le début du mois de mai.

Admissibilité

  • Peuvent présenter une demande les stagiaires/travailleurs hautement qualifiés (THQ) (étudiants diplômés, postdoctorants, associés de recherche et/ou techniciens de recherche) travaillant actuellement dans un laboratoire canadien sur un projet de recherche associé au domaine des cellules souches et de la médecine régénératrice.
  • Si vous avez des doutes quant à votre admissibilité, veuillez confirmer la chose avec nous le plus tôt possible en nous écrivant à l’adresse trainingSCN@stemcellnetwork.ca.

Les demandeurs doivent clairement démontrer qu’ils auront l’occasion d’appliquer les techniques apprises au cours à leur propre projet de recherche dans l’année qui suivra la formation.

Conditions

  • Notez que les participants à cette formation devront utiliser leur propre ordinateur portable, ainsi que des écouteurs, pour entendre, et une webcam pour les interactions vidéo. Un deuxième moniteur/écran est également fortement recommandé.
  • Le nombre de places est limité pour cette importante formation. Le RCS remboursera les coûts d’inscription à cet atelier (payés directement aux organisateurs) assumés par les demandeurs qui auront participé à toutes les séances et qui auront terminé tous les éléments du contenu en ligne au cours de la période prescrite. Dans le cas des personnes qui n’auront pas réussi à participer à toutes les séances ou à terminer tout le contenu de l’atelier, des frais de 700 $ seront chargés à leur superviseur·e pour couvrir les coûts associés à la prestation de cette occasion de formation. 
  • En échange de leur participation à l’atelier, les participants doivent accepter de fournir un rapport décrivant la valeur des occasions de formation et de réseautage offertes grâce à la bourse. Ces informations seront utilisées à la discrétion du RCS, par exemple sur son site Web, dans ses bulletins d’information et dans le but de faire rapport à ses organismes subventionnaires.En s’inscrivant à cet événement, les participants acceptent également de se faire photographier. Les photographies prises pourront être utilisées dans les documents mentionnés ci-dessus.
  • En s’inscrivant à cet événement, les participants acceptent également de se faire photographier. Les photographies prises pourront être utilisées dans les documents mentionnés ci-dessus.